MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Aeromonas salmonicida subsp. salmonicida A449

Total Repeats: 103098

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
103001	NC_009348	CAG	2	6	4698030	4698035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301204
103002	NC_009348	ATG	2	6	4698046	4698051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145301204
103003	NC_009348	CAGC	2	8	4698123	4698130	25 %	0 %	25 %	50 %	145301204
103004	NC_009348	GGT	2	6	4698152	4698157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145301204
103005	NC_009348	ACCC	2	8	4698192	4698199	25 %	0 %	0 %	75 %	145301204
103006	NC_009348	CTG	2	6	4698222	4698227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301204
103007	NC_009348	GCG	2	6	4698248	4698253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145301204
103008	NC_009348	ATG	2	6	4698265	4698270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145301204
103009	NC_009348	TCG	2	6	4698316	4698321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301204
103010	NC_009348	AGT	2	6	4698347	4698352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145301204
103011	NC_009348	GCA	2	6	4698356	4698361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301204
103012	NC_009348	ACC	2	6	4698372	4698377	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145301204
103013	NC_009348	TGG	2	6	4698380	4698385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145301204
103014	NC_009348	TCG	2	6	4698412	4698417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301204
103015	NC_009348	CTT	2	6	4698426	4698431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145301204
103016	NC_009348	CT	3	6	4698439	4698444	0 %	50 %	0 %	50 %	145301204
103017	NC_009348	CCA	2	6	4698460	4698465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145301204
103018	NC_009348	TGT	2	6	4698569	4698574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145301204
103019	NC_009348	ACG	2	6	4698670	4698675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301204
103020	NC_009348	GGC	2	6	4698714	4698719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145301204
103021	NC_009348	GAC	2	6	4698731	4698736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301204
103022	NC_009348	CCA	2	6	4698767	4698772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145301204
103023	NC_009348	CAG	2	6	4698813	4698818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301204
103024	NC_009348	CAG	2	6	4698858	4698863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301204
103025	NC_009348	GGA	2	6	4698918	4698923	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145301204
103026	NC_009348	TGCG	2	8	4698938	4698945	0 %	25 %	50 %	25 %	145301204
103027	NC_009348	TTC	2	6	4699144	4699149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145301205
103028	NC_009348	ACC	2	6	4699175	4699180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145301205
103029	NC_009348	CAG	2	6	4699307	4699312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301205
103030	NC_009348	CTC	2	6	4699411	4699416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145301206
103031	NC_009348	ACG	2	6	4699451	4699456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301206
103032	NC_009348	GGCT	2	8	4699473	4699480	0 %	25 %	50 %	25 %	145301206
103033	NC_009348	T	6	6	4699549	4699554	0 %	100 %	0 %	0 %	145301206
103034	NC_009348	GA	3	6	4699689	4699694	50 %	0 %	50 %	0 %	145301206
103035	NC_009348	GCG	2	6	4699701	4699706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145301206
103036	NC_009348	ACG	2	6	4699743	4699748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301207
103037	NC_009348	GCGCTT	2	12	4699806	4699817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301207
103038	NC_009348	GATTC	2	10	4699848	4699857	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
103039	NC_009348	GAC	2	6	4699915	4699920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103040	NC_009348	CCG	2	6	4699967	4699972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
103041	NC_009348	TCA	2	6	4699995	4700000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103042	NC_009348	GGA	2	6	4700027	4700032	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103043	NC_009348	TCC	2	6	4700077	4700082	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103044	NC_009348	A	6	6	4700086	4700091	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103045	NC_009348	GGC	2	6	4700092	4700097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
103046	NC_009348	GCC	2	6	4700101	4700106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
103047	NC_009348	AG	4	8	4700109	4700116	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103048	NC_009348	CGG	2	6	4700183	4700188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145301208
103049	NC_009348	C	6	6	4700208	4700213	0 %	0 %	0 %	100 %	145301208
103050	NC_009348	CAC	3	9	4700267	4700275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145301208
103051	NC_009348	TCA	2	6	4700305	4700310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145301208
103052	NC_009348	TCG	2	6	4700322	4700327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301208
103053	NC_009348	GCC	2	6	4700385	4700390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145301208
103054	NC_009348	TGC	2	6	4700415	4700420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301208
103055	NC_009348	CCG	2	6	4700424	4700429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145301208
103056	NC_009348	GA	4	8	4700430	4700437	50 %	0 %	50 %	0 %	145301208
103057	NC_009348	GCT	2	6	4700518	4700523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301208
103058	NC_009348	TGT	2	6	4700551	4700556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145301208
103059	NC_009348	TTG	2	6	4700568	4700573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145301208
103060	NC_009348	AGG	2	6	4700602	4700607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145301208
103061	NC_009348	CTG	2	6	4700630	4700635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301208
103062	NC_009348	ATC	2	6	4700666	4700671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145301208
103063	NC_009348	GCAGC	2	10	4700714	4700723	20 %	0 %	40 %	40 %	145301208
103064	NC_009348	TGCCGG	2	12	4700734	4700745	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	145301208
103065	NC_009348	TTG	2	6	4700808	4700813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145301208
103066	NC_009348	ATC	2	6	4700847	4700852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145301208
103067	NC_009348	CAG	2	6	4700891	4700896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301209
103068	NC_009348	TGC	2	6	4700898	4700903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301209
103069	NC_009348	GAT	2	6	4700915	4700920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145301209
103070	NC_009348	ACC	3	9	4700922	4700930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145301209
103071	NC_009348	GAA	2	6	4700963	4700968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145301209
103072	NC_009348	AGG	4	12	4700974	4700985	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145301209
103073	NC_009348	AGT	2	6	4701064	4701069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145301209
103074	NC_009348	TCA	2	6	4701070	4701075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145301209
103075	NC_009348	GCC	2	6	4701096	4701101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145301209
103076	NC_009348	CCG	2	6	4701116	4701121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145301209
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103079	NC_009348	CGA	2	6	4701241	4701246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301209
103080	NC_009348	GGC	2	6	4701248	4701253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145301209
103081	NC_009348	GTA	2	6	4701302	4701307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145301209
103082	NC_009348	AGC	2	6	4701327	4701332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301209
103083	NC_009348	GCCA	2	8	4701366	4701373	25 %	0 %	25 %	50 %	145301209
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103085	NC_009348	CAT	2	6	4701527	4701532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145301209
103086	NC_009348	CGT	2	6	4701613	4701618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145301210
103087	NC_009348	CTT	2	6	4701623	4701628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145301210
103088	NC_009348	CAG	2	6	4701629	4701634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301210
103089	NC_009348	AGGGC	2	10	4701661	4701670	20 %	0 %	60 %	20 %	145301210
103090	NC_009348	TCT	2	6	4701826	4701831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145301210
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103093	NC_009348	CAG	2	6	4702247	4702252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145301210
103094	NC_009348	GGC	2	6	4702256	4702261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145301210
103095	NC_009348	GATG	2	8	4702277	4702284	25 %	25 %	50 %	0 %	145301210
103096	NC_009348	CT	4	8	4702300	4702307	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103097	NC_009348	GTT	2	6	4702308	4702313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103098	NC_009348	TA	3	6	4702390	4702395	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.